مطالعه گونه‌های Cylindrocarpon همراه با پوسیدگی ریشه و طوقه ذرت و کلزا در استان خوزستان *

به منظور شناسایی و مطالعه گونه‌های Cylindrocarpon همراه با ریشه و طوقه کلزا و ذرت در استان خوزستان طی سال زراعی 1386- 1385، از مزارع کلزا و ذرت در مناطق ایذه، دزفول، شوشتر، شوش، اندیمشک و ملاثانی نمونه‌برداری به عمل آمد. در این بررسی پنج گونه از جنس سیلندروکارپن شناسایی شد که به ترتیب فراوانی شامل C. destructans(96 جدایه)، C. didymium (69 جدایه)، ‌hederaeC. (25 جدایه)، C. obtusisporum (14 جدایه) و C. macrodidymum (3 جدایه) بودند. جداسازی گونه‌های مذکور از ذرت و کلزا برای اولین بار در دنیا انجام می‌شود. در این تحقیق از جفت آغازگرهای ITS4 & ITS5 برای شناسایی گونه‌های سیلندروکارپن استفاده شد. محصول تکثیر شده از DNA جدایه‌های سیلندروکارپن با استفاده از آغازگرهای اختصاصی، قطعه‌ای به وزن 560-500 جفت باز تکثیر نمود. مقایسه توالی‌های به دست آمده از گونه‌های فوق با توالی‌های موجود در بانک ژن، با استفاده از ابزار جستجویBLAST(Basic Local Alignment Search Tool)، نشان داد که تمامی توالی‌های به‌دست آمده از نمونه‌های مورد بررسی به گونه‌های سیلندروکارپن تعلق دارند. گروه‌بندی گونه‌های سیلندروکارپن با استفاده از توالی ITS مناطق ریبوزومی مطابق با طبقه‌بندی بر اساس خصوصیات مرفولوژیکی ارائه شده است. این مطلب نشان می‌دهد که تعیین توالی ITS مناطق ریبوزومی یک ابزار مفید و کار‌آمد در ارزیابی رابطه فیلوژنتیکی گونه‌های جنس سیلندروکارپن است.